В экспозиции представлено более 500 экспонатов из фондов музея: археологические находки (кирпичи, кровельная черепица, торцы для мощения мостовых, найденные на территории Петропавловской крепости, характеризующие уровень развития строительной техники в ХVIII-ХIХ веках); архитектурная графика; русские и шведские планы и карты начала ХVIII века, демонстрирующие стратегически важное месторасположение крепости; гравюры и фотографии; коллекция строительных и столярных инструментов; макеты и другие материалы, на основе которых воссозданы элементы фортификационных сооружений, утраченные за более чем трехсотлетнее существование памятника.